Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp4f39Q8BGU0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms