Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ3

Uncharacterized protein C17orf100 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGJ3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Q8BGJ3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Q8BGJ3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Q8BGJ3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Q8BGJ3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms