Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Ubash3bQ8BGG7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms