Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms