Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp4Q8BFV3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp4Q8BFV3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms