Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms