Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem39bQ810L4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms