Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo1Q80ZD8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo1Q80ZD8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo1Q80ZD8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo1Q80ZD8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo1Q80ZD8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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