Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crb2Q80YA8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crb2Q80YA8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms