Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms