Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnupnQ80W37 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnupnQ80W37 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms