Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhrnQ80VW5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms