Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp8Q80U87 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp8Q80U87 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp8Q80U87 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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