Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo1Q7TT28 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms