Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo2Q7TSY8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms