Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IfnkQ7TSL0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms