Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms