Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms