Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms