Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN73

Casd1, N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casd1Q7TN73 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casd1Q7TN73 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casd1Q7TN73 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms