Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms