Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcl2Q78Y63 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcl2Q78Y63 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms