Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms