Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms