Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms