Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SynmQ70IV5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms