Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpv1Q704Y3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms