Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl35Q6ZWV7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rpl35Q6ZWV7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rpl35Q6ZWV7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms