Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms