Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms