Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54bQ6PFE3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms