Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms