Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms