Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms