Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp49Q6P9L4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp49Q6P9L4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp49Q6P9L4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp49Q6P9L4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp49Q6P9L4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Usp49Q6P9L4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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