Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl3Q6P1Y1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms