Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slx4Q6P1D7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms