Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Soga3Q6NZL0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Soga3Q6NZL0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms