Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc3bQ6NWW9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms