Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HelbQ6NVF4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HelbQ6NVF4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HelbQ6NVF4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HelbQ6NVF4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HelbQ6NVF4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms