Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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