Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms