Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rftn1Q6A0D4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms