Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cep290Q6A078 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cep290Q6A078 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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