Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms