Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Pdzrn3Q69ZS0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Pdzrn3Q69ZS0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms