Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brsk2Q69Z98 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms