Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cntn4Q69Z26 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms