Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4fQ66X05 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms