Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PtprdQ64487 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PtprdQ64487 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PtprdQ64487 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PtprdQ64487 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PtprdQ64487 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PtprdQ64487 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PtprdQ64487 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PtprdQ64487 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PtprdQ64487 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprdQ64487 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprdQ64487 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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